Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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