Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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