Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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