Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms