Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKOR1P84550 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms