Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGDP52209 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGDP52209 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGDP52209 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms