Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms