Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP2P42575 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms