Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TSPOP30536 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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