Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms