Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms