Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms