Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB5P09067 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms