Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POP4O95707 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POP4O95707 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POP4O95707 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POP4O95707 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms