Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSVO60911 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSVO60911 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms