Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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