Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM2O43147 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms