Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms