Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD12O00232 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD12O00232 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms