Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms