Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms