Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms