Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTF2Q9UNY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms