Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms