Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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