Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT172Q9UG01 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms