Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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