Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms