Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms