Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms