Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHOXF2Q9BQY4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms