Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms