Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms