Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms