Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms