Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF12Q99081 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms