Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms