Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT8L2Q96SF2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT8L2Q96SF2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms