Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms