Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf85Q96MD7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms