Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms