Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms