Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF8Q5VWM4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF8Q5VWM4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms