Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LDLRAP1Q5SW96 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms