Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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