Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDCD2Q16342 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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