Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TAF1AQ15573 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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