Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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