Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PDE7AQ13946 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PDE7AQ13946 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE7AQ13946 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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