Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL1Q13616 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL1Q13616 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL1Q13616 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL1Q13616 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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